对于化学专业的人来说,使用化学专业画图软件恐怕比wordoffice还频繁,对化学结构比文字还敏感。。。常用化学专业画图软件如Origin,ChemOffice,ACD/ChemSketch,ISIS/Draw,ChemWindow,还有一款国人开发的Indraw,各有各的优势和特点,在使用上呢萝卜白菜各有所爱。
其中ChemOffice是美国剑桥公司的研究开发的桌面化学软件,功能非常强大。ChemDraw是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件,是各论文期刊指定的格式,也是大家在使用ChemOffice时用得最多的软件。今天要说是Chemoffice其中的一个功能——ChemFinder。ChemFinder(化学信息搜寻整合系统),用过的人可能知道,它主要是建立化学数据库、储存及搜索查找,也可以化合物或试剂批量导入/分类导出。或搭配ChemDraw、Chem3D使用,也可以使用现成的化学数据库。
ChemFinder是一个智能型的快速化学搜寻引擎,所提供的ChemInfo是目前世界上最丰富的数据库之一。不仅为化学工作者提供了一个查询存储和管理化学结构、物理属性以及数据表格等信息的解决方案,用户还可以使用ChemFinder建立自己的数据库。适合个人、高校课题组或者企业进行化合物/试剂或其他管理。(可能机智的你们早已用上。。。)
应用:举个粗糙的例子↓↓↓(下图中还可以增加一项“合成路线”的表单,学生党可以用它方便管理自己合成的中间体,再也不用担心时间久忘了做过啥以及怎么做的)
(如果方法一太麻烦,请耐心往下看→_→二才是大招。。。)
建立ChemFinder数据库具体步骤(方法一): 第1步:制作表单在制作表单之前先打开ChemFinder,如下。
上图界面有三个选项“Blankform”、“DatabaseConnection”和“DatabaseWizard”
选择前两个选项都可以用方法一来建库,如下:
①点击“Blankform”
或②点击“DatabaseConnection”
打开后可以制作表单了,如下(点击“Blankform”后的界面可以直接制作表单):
在使用ChemFinder制作表单之前,一定要熟悉了解ChemFinder主要工具的功能和操作方法,左侧一栏有9项主要工具,如下图所示:
ChemFinder主要工具
从上至下依次是选择工具、数据框工具、边框工具、数据边框工具、文本工具、图片工具、按钮工具、子表格工具以及栅格工具,使用方法很简单,根据需要选择某工具之后即可在表单窗口进行编辑。
ChemFinder制作表单步骤1、新建表单:一般情况下打开ChemFinder就会自动生成起始表单,如果系统没有生成,用户单击File菜单的新建命令或者直接单击“新建按钮”来新建空白表单。
2、新建数据框:选择“数据框工具”并在原始表单窗口拖拉生成数据框,用同样的方法新建多个数据框。
3、数据框标记:所谓数据框标记就是为数据框命名以作区分,选择“文本工具”并在数据框附近拖拉生成文本输入框,输入数据库名称后单击OK按钮即可。
图:标记表单数据框
、保存表单:表单制作完毕后,单击File的保存命令或者直接单击“保存”按钮,在弹出的对话框中输入表单名称mydb.cfx,默认保存为ChemFinder的.cfx格式,较老版本的ChemFinder可以保存为.cfw格式。
第2步:CreateDatabase(建数据库)在新建表单上右击并选择DataSource(数据来源)命令,在弹出的对话框中选择CreateDatabase(创立数据库)选项(点击“DatabaseConnection”后直接进入该界面),如下图所示:
第3步:数据库命名在弹出的保存对话框中为新建ChemFinder数据库命名,数据库文件格式为.mdb。
第步:创立数据库类型保存完毕返回ChemFinder仓窗口时即可为数据库创立类型,如下图红框中所示:
图:创立数据库类型(上述红标内的数据框为系统自生成,除此之外的数据框可根据需求任意添加,“structure”可以在里面直接画结构或者copy进来。)
第5步:CreateFiled(建字段)在BoxProperties对话框中单击Field选项并点击CreateFiled(创立字段)选项,为数据库类型建立字段,包括字段名称、字段类型和宽度三个参数,设置完成后单击OK按钮字段设置成功,新创立MeltingPoint字段如下图所示:
图:新建数据库字段
(数据框的个数以及字段创立,根据实际需求来定义)
第6步:分配字段返回ChemFinder表单窗口,在不同区域分配字段,操作方法是在数据框内右击,然后选择对应的字段,比如“结构”数据框就选择“Structure”命令,“分子量”数据框就选择“MolWeight”命令,为每个数据框都选择对应的字段,否则该数据框不显示任何化学信息。(根据需求执行第六步操作,一般可以不用该功能。。。)
图:分配字段
以上就是使用ChemFinder自己建立数据库的具体步骤,想学习者能够亲身操作一遍,加深理解和应用。
建立ChemFinder数据库具体步骤(方法二):直接看图说话,简单快捷傻瓜操作如方法一,打开之后,选择第三个选项“Databasewizard”
下一步:
下一步:
下一步:
下一步:
完成:
点击完成后出现下述界面,里面什么也没有,现在可以添加了。。。
添加数据框:空白处点鼠标右键,弹出菜单选择“properties”
下一步:右上四个菜单选择“field”
下一步:
下一步:点击应用,数据框添加完成。添加完成的数据框可以随时重命名或者移动位置
下一步:数据库建成,可以往里面录入化合物/中间体/试剂/反应路线/或者其它信息了。。。若后续添加化合物点击图中标志,若需查找化合物,在任一数据框输入查找条件就可以啦!!!
(比如structure中画结构,或者CAS号或者名称,都可以进行精确或模糊匹配)
其中化学人士钟爱的结构搜索法,可以二级匹配查找,此项绝对是做药化构效关系的利器,不浪费任何试剂,是不是比excel管理试剂库简单多了?如果是终产品,还可以再添加structure框,用来存储合成路线,这样就不用担心再合成时翻那些成堆的实验记录了。。。
Chemfinder数据库跟wordoffice兼容的情况下,还可以将excel表单内容导入chemfinder,或者将chemfinder导出到excel表单,简单方便使用低成本(敢说你用的不是破解版?←_←),离线数据库安全妥妥的,下期咱们继续聊~^~
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